ARKEOGENETİK UYGULAMA ALANLARI  

İNSAN ARAŞTIRMALARINDA

AFRİKA 

Modern insanların Afrika’da en az 200 kya (bin yıl önce) ^[1] 300 kya’nın üzerinde bir tarih öneren bazı kanıtlarla evrimleştiği düşünülmektedir. ^[2] Mitokondriyal DNA (mtDNA), Y kromozomu DNA’sı ve X kromozomu DNA’sının incelenmesi, Afrika’dan ayrılan en erken popülasyonun yaklaşık 1500 erkek ve kadından oluştuğunu göstermektedir.^[1] Çeşitli araştırmalarda, popülasyonların Afrika dışına yayılmadan önce bir dereceye kadar coğrafi olarak “yapılandırıldığı” öne sürülmüştür; bu, paylaşılan mtDNA soylarının eskiliği tarafından önerilmektedir.^[1] Kıtanın çeşitli yerlerinden 121 popülasyon üzerinde yapılan bir araştırma, Afrika popülasyonlarına eski bir coğrafi yapı öneren 14 genetik ve dilsel “küme” buldu.^[1] Genel olarak, genotipik ve fenotipik analizler, “evrimsel tarihlerinin çoğu boyunca geniş ve alt bölümlere ayrılmış” olduğunu göstermiştir. ^[1]

Genetik analiz, Bantu konuşanların Güney Afrika’ya yaklaşık 5 kya’ya büyük ölçekli göçlerinin arkeolojik hipotezlerini destekledi. ^[1] Mikro uydu DNA, tek nükleotid polimorfizmleri (SNP’ler) ve insersiyon/delesyon polimorfizmleri (INDELS) Nilo-Sahra konuşan popülasyonların Sudan kökenli olduğunu göstermiştir. ^[1] Ayrıca, Nilo-Sahraca konuşanların Çad konuşan torunlarının Sudan’dan Çad Gölü’ne yaklaşık 8 kya göç ettiğine dair genetik kanıtlar vardır.^[1] Genetik kanıtlar, Afrikalı olmayan popülasyonların Afrika gen havuzuna önemli katkılarda bulunduğunu da göstermiştir.^[1] Örneğin, Sahra Afrikalı Beja halkı, yüksek düzeyde Orta Doğu ve Doğu Afrika Cushitic DNA’sına sahiptir. ^[1]

AVRUPA 

mtDNA analizi, Avrasya’nın 60 ile 70 kya arasında tek bir göç olayında işgal edildiğini gösteriyor.^[1] Genetik kanıtlar, Yakın Doğu ve Avrupa’nın işgalinin 50 kya’dan daha erken olmadığını gösteriyor.^[1] Haplogrup U’yu incelemek, Yakın Doğu’dan hem Avrupa’ya hem de Kuzey Afrika’ya ayrı dağılmalar gösterdi. ^[1]

Arkeogenetikte yapılan çalışmaların çoğu, Avrupa’daki Neolitik geçişe odaklanmaktadır.^[3] Cavalli-Svorza’nın genetik-coğrafi örüntüler analizi, onu Neolitik Çağ’ın başlangıcında Avrupa’ya büyük bir Yakın Doğu popülasyonu akışı olduğu sonucuna varmasına yol açtı. ^[3] Bu görüş onu “yerli Mezolitik toplayıcı nüfuslar pahasına genişleyen erken çiftçileri güçlü bir şekilde vurgulamaya” götürdü.^[3] 1990’lardaki mtDNA analizi ise bu görüşle çelişiyordu. MB Richards, mevcut Avrupa mtDNA’larının %10-22’sinin Neolitik dönemde Yakın Doğu popülasyonlarından geldiğini tahmin ediyor. ^[3] Çoğu mtDNA, mevcut Mezolitik ve Paleolitik gruplar arasında “zaten kurulmuştu”.^[3] Modern Avrupa mtDNA’sının çoğu “kontrol bölgesi soyu”, Son Buzul Maksimumunun (LGM) sonuna doğru kuzey Avrupa’yı yeniden işgal eden kurucu bir olaya kadar izlenir. ^[1] Mevcut Avrupa mtDNA’ları üzerine yapılan bir çalışma, bu yeniden işgalin LGM’nin sona ermesinden sonra meydana geldiğini öne sürüyor, ancak bir başkası bunun daha önce gerçekleştiğini öne sürüyor.^[1][3] V, H ve U5 haplogruplarının analizi, toplayıcı popülasyonların gelen Neolitik popülasyonlara dahil edilmesiyle Avrupa işgalinin “öncü kolonizasyon” modelini desteklemektedir.^[3] Ayrıca, sadece mevcut DNA’nın değil, eski DNA’nın analizi bazı konulara ışık tutuyor. Örneğin, neolitik ve mezolitik DNA’nın karşılaştırılması, sütçülüğün gelişiminin yaygın laktoz toleransından önce geldiğini göstermiştir. ^[3]

GÜNEY ASYA 

Güney Asya, modern insanların Afrika dışından coğrafi dağılımı için ana erken koridor görevi gördü.^[4] MtDNA hattı M ile ilgili çalışmalara dayanarak, bazıları Hindistan’ın ilk sakinlerinin yaklaşık 45-60 kya’ya giren Avusturya-Asya dili konuşanları olduğunu öne sürdüler. ^[4] Hint gen havuzu, en erken yerleşimcilerin yanı sıra, 8 kya’dan daha erken olmayan göçlerden Batı Asya ve Orta Asya popülasyonlarının katkılarına sahiptir. ^[4] Y kromozomu soylarına kıyasla mtDNA soylarında varyasyon olmaması, bu göçlere öncelikle erkeklerin katıldığını göstermektedir. ^[4] Orta Asya’da ortaya çıkan U mtDNA soyunun U2i ve U2e alt dallarının keşfi, Orta Asya’dan Hindistan’a büyük bir göçün görüşlerini “modülasyona uğrattı”, çünkü iki dal 50 kya ayrıldı. ^[4] Ayrıca, U2e Avrupa’da büyük yüzdelerde bulunur, ancak Hindistan’da bulunmaz ve U2i için tam tersi, U2i’nin Hindistan’a özgü olduğu anlamına gelir. ^[4]

DOĞU ASYA 

mtDNA ve NRY (Y kromozomunun yeniden birleşmeyen bölgesi) dizilerinin analizi, Afrika dışına ilk büyük dağılmanın Suudi Arabistan ve Hindistan kıyılarından 50-100 kya’dan geçtiğini ve ikinci bir büyük dağılmanın Himalayaların  15-50 kya kuzeyinde meydana geldiğini göstermiştir. ^[5]

Doğu Asya’daki kuzeyden güneye ve güneyden kuzeye göçlerin kapsamını keşfetmek için pek çok çalışma yapılmıştır.^[4] Kuzeydoğu gruplarının genetik çeşitliliğini güneydoğu gruplarıyla karşılaştırmak, arkeologların kuzeydoğu Asya gruplarının çoğunun güneydoğudan geldiği sonucuna varmalarına izin verdi.^[5] Pan-Asya SNP (tek nükleotid polimorfizmi) çalışması, “haplotip çeşitliliği ve enlem arasında güçlü ve oldukça anlamlı bir ilişki” buldu ve bu, demografik analizle birleştiğinde, öncelikle Doğu Asya güneyden kuzeye bir yerleşim durumunu destekler. ^[5] Arkeogenetik, Japonya’dan Ainu ve Filipinler’deki Negrito grupları gibi bölgedeki avcı-toplayıcı popülasyonları incelemek için de kullanılmıştır.^[5] Örneğin, Pan-Asya SNP çalışması, Malezya’daki Negrito popülasyonlarının ve Filipinler’deki Negrito popülasyonlarının, Negrito olmayan yerel popülasyonlarla birbirinden daha yakından ilişkili olduğunu, Negrito ve Negrito olmayan popülasyonların tek bir giriş olayıyla bağlantılı olduğunu öne sürdü. Doğu Asya’ya; Avustralya Aborjinleri de dahil olmak üzere diğer Negrito grupları benzerlikler paylaşmaktadır.^[5] Bunun olası bir açıklaması, bazı Negrito gruplarının yerel nüfuslarıyla yakın zamanda karıştırılmasıdır.

AMERİKA 

Arkeogenetik, Amerika’nın Asya’dan nüfusunu daha iyi anlamak için kullanılmıştır.^[6] Kızılderili mtDNA haplogruplarının, bu tahminlerde bazı farklılıklar olmasına rağmen, 15 ile 20 kya arasında olduğu tahmin edilmektedir.^[6]

Genetik veriler, Amerika’nın nasıl sömürgeleştirildiğine ilişkin çeşitli teoriler önermek için kullanılmıştır.^[6] En yaygın olarak kabul edilen teori, LGM’den sonra Bering Boğazı üzerinden göçün “üç dalgasını” öne sürse de, genetik veriler alternatif hipotezlere yol açmıştır. ^[6] Örneğin, bir hipotez, Sibirya’dan Güney Amerika’ya 20-15 kya arasında bir göç ve buzul durgunluğundan sonra meydana gelen ikinci bir göç önermektedir. ^[6] Y kromozomu verileri, bazılarının LGM’den sonra 17.2–10.1 kya arasında Sibirya’nın Altay Dağları’ndan başlayarak tek bir göç olduğunu kabul etmesine yol açmıştır.^[6] Hem mtDNA hem de Y-kromozom DNA’sının analizi, “küçük, kurucu popülasyonların” kanıtını ortaya koyuyor. ^[6] Haplogrupları incelemek, bazı bilim adamlarının küçük bir popülasyondan Amerika’ya güneyden bir göçün imkansız olduğu sonucuna varmasına yol açtı, ancak ayrı bir analiz böyle bir modelin kıyılarda böyle bir göç olması durumunda uygulanabilir olduğunu buldu. ^[6]

AVUSTRALYA VE YENİ GİNE 

Son olarak, Avustralya ve Yeni Gine’nin işgalini incelemek için arkeogenetik kullanılmıştır. ^[7] Avustralya ve Yeni Gine aborjinleri fenotipik olarak çok benzerdir, ancak mtDNA bunun benzer koşullarda yaşamanın yakınsamasından kaynaklandığını göstermiştir.^[7] mt-DNA’nın kodlanmayan bölgeleri, Avustralya ve Yeni Gine’nin yerli popülasyonları arasında “benzerlik” göstermedi.^[7] Ayrıca, iki popülasyon arasında hiçbir büyük NRY soyu paylaşılmaz. Avustralya’ya özgü tek bir NRY soyunun yüksek frekansı, “soyla ilişkili Y-kromozomal kısa tandem tekrarı (Y-STR) haplotiplerinin düşük çeşitliliği” ile birleştiğinde, Avustralya’da “yakın zamanda bir kurucu veya darboğaz” olayı için kanıt sağlar.^[7] Ancak, mtDNA’da nispeten büyük bir çeşitlilik vardır; bu, darboğaz etkisinin öncelikle erkekleri etkilediğini ima eder.^[7] Birlikte, NRY ve mtDNA çalışmaları, iki grup arasındaki bölünme olayının 50kya’nın üzerinde olduğunu ve ikisi arasındaki son ortak ataya dair şüphe uyandırdığını gösteriyor. ^[7]

BİTKİLER VE HAYVANLAR  

Arkeogenetik, bitki ve hayvanların evcilleştirilmesinin gelişimini anlamak için kullanılmıştır.

BİTKİLERİN EVCİLLEŞTİRİLMESİ  

Genetik ve arkeolojik bulguların kombinasyonu, dünya çapında bitki evcilleştirilmesinin en erken belirtilerini izlemek için kullanılmıştır. Bununla birlikte, evcilleştirmenin başlangıç ​​anını izlemek için kullanılan nükleer, mitokondriyal ve kloroplast genomları farklı oranlarda evrimleştiğinden, soy kütüğünü izlemek için kullanımı biraz sorunlu olmuştur. ^[8] Spesifik olarak nükleer DNA, daha hızlı mutasyon oranı ve daha yüksek polimorfizm genetik belirteçleri nedeniyle intraspesifik varyasyonu nedeniyle mitokondriyal ve kloroplast DNA üzerinde kullanılır.^[8] Mahsul ‘evcilleştirme genleri’ndeki (özellikle lehte veya aleyhte seçilen özellikler) bulgular şunları içerir:

• tb1 (teosinte dallı1) – mısırda apikal baskınlığı etkiler ^[8]
• tga1 (teosinte glume mimarisi1) – mısır tanelerini insanların rahatlığı için uyumlu hale getirmek ^[8]
• te1 (Terminal kulak1) – çekirdeklerin ağırlığını etkiler ^[8]
• fw2.2 – domateslerde ağırlığı etkiler ^[8]
• BoCal – brokoli ve karnabaharın çiçeklenmesi ^[8]

Bitkilerin evcilleştirilmesinde arkeogenetik çalışmaları sayesinde, ilk küresel ekonominin işaretleri de ortaya çıkarılabilir. Bir bölgede yüksek oranda seçilmiş yeni mahsullerin coğrafi dağılımı, orijinal olarak tanıtılmayacak başka bir yerde bulunması, hazır kaynakların üretimi ve tüketimi için bir ticaret ağının kanıtı olarak hizmet eder.^[8]

HAYVANLARIN ARAŞTIRILMASI 

Arkeogenetik, hayvanların evcilleştirilmesini incelemek için kullanılmıştır.^[9] Araştırmacılar, evcilleştirilmiş hayvan popülasyonlarındaki genetik çeşitliliği analiz ederek, ata türlerin olası özellikleri hakkında değerli bilgiler vermek için DNA’daki genetik belirteçleri arayabilirler.^[9] Bu özellikler daha sonra arkeolojik kalıntıları vahşi ve evcilleştirilmiş örnekler arasında ayırt etmeye yardımcı olmak için kullanılır. ^[40] Genetik çalışmalar, evcilleştirilmiş hayvanların atalarının belirlenmesine de yol açabilir. ^[9] Mevcut popülasyonlarla ilgili genetik çalışmalardan elde edilen bilgiler, Arkeologların bu ataları belgeleme arayışına rehberlik etmeye yardımcı olur.^[9]

Arkeogenetik, eski dünyada domuzların evcilleştirilmesinin izini sürmek için kullanılmıştır.^[9] Bu çalışmalar aynı zamanda erken çiftçilerin ayrıntıları hakkında kanıtlar ortaya koymaktadır.^[10] Arkeogenetik yöntemleri de köpeklerin evcilleştirilmesinin gelişimini daha iyi anlamak için kullanılmıştır.^[11] Genetik çalışmalar, tüm köpeklerin gri kurdun soyundan geldiğini göstermiştir, ancak şu anda köpeklerin ne zaman, nerede ve kaç kez evcilleştirildiği bilinmemektedir. ^[11] Bazı genetik çalışmalar çoklu evcilleştirmeyi gösterirken diğerleri göstermemiştir.^[11] Arkeolojik bulgular, köpeklerin evcilleştirilmesinin ilerlemesi hakkında sağlam kanıtlar sağlayarak bu karmaşık geçmişi daha iyi anlamaya yardımcı olur.^[10]  İlk insanlar köpekleri evcilleştirdikçe, gömülü köpeklerin arkeolojik kalıntıları giderek daha bol hale geldi.^[10] Bu sadece arkeologların kalıntıları incelemesi için daha fazla fırsat sağlamakla kalmaz, aynı zamanda erken insan kültürü hakkında da ipuçları sağlar. ^[10]