Hayvanları enfekte eden virüsler, bir türden diğerine atlayabilir ve yeni konakta, genellikle ciddi bir hastalığa neden olabilirler. Örneğin, Coronaviridae ailesindeki bir virüs, at nalı yarasalar rezervuarından insanlara geçiş yaparak şiddetli akut solunum sendromuna (SARS) neden oldu. SARS koronavirüsünün at nalı yarasalarından insanlara atlayabilme yeteneği şüphesiz virüste genetik değişikliklerden kaynaklıydı. İnsanları enfekte eden, antijenik kayma adı verilen ve pandemiye neden olan bu virüsler dramatik bir antijenik değişikliğe uğrayabilir. Bu değişikliğe uğrayan influenza A virüsleri, vahşi kuşları oluşturan büyük bir hayvan rezervuarına sahiptir. İnfluenza A virüslerinin RNA genomu sekiz segment formundadır. Bir ara konak (muhtemelen domuz) aynı anda bir insan ve bir kuş gribi A virüsü ile enfekte olursa, genom RNA segmentleri yeniden aktive edilebilir. Bu durum immünolojik olarak influenza A virüslerinden farklı bir yüzey proteinine sahip insan popülasyonunda salgınlaşan yeni bir virüs şeklinde ortaya çıkar. İnsan nüfusunun yeni virüse karşı çok az immünolojik koruması olacağı veya hiç olmayacağı için, bir pandemik salgın ortaya çıkacaktır. Büyük olasılıkla 1957 Asya gribi salgını ve 1968 Hong Kong gribi salgını bu şekilde gerçekleşti. Pandemik influenza A virüsleri de farklı bir mekanizma ile ortaya çıkabilir. Neden olan türün 1918-1919 influenza salgını, sekiz RNA segmentinin tümü bir kuş virüsünden türemiştir ve bu virüs daha sonra memeli hücrelerine adaptasyon sürecinde birden fazla mutasyon geçirmiştir. Kuş gribi virüsleri yayılarak, Asya, Avrupa ve Afrika’da 1990’lardan bu yana sürdürdüğü güzergahını pandemik yeteneği ile devam ettirecek gibi görünüyor. Bu virüsler, kuş genleri taşıyan tavuklar için yüzde 50 daha fazla ölüm oranına yol açarken insanlar için çok daha patojenikti. Kuş gribi virüsleri henüz insanlardan insana etkili bir şekilde bulaşma kabiliyeti kazanmamıştır ve bunun için hangi genetik değişikliklerin yapılması gerektiği bilinmemektedir. Virüsler; nükleik asit içeriği, boyutları, protein kapsidlerinin şekli ve çevreleyen bir lipoprotein zarfının varlığına göre sınıflandırılır. Birincil taksonomik bölünme, nükleik asit içeriğine dayalı olarak iki sınıfa ayrılır: DNA virüsleri veya RNA virüsleri. DNA virüsleri, çift sarmallı veya tek sarmallı DNA içerenler şeklinde bölünür. RNA virüsleri ayrıca çift sarmallı veya tek sarmallı RNA içerenler olarak ayrılır. RNA virüslerinin daha da alt bölümlere ayrılması, RNA genomunun bölümlenip bölünmediğine dayanmaktadır. Virüsler, tek iplikli RNA’yı genetik bilgi, eğer pozitif iplikçik virüslere ayrılırlarsa RNA’nın bir polimeraz tarafından mRNA’ya kopyalanması gerekiyorsa, RNA haberci (doğrudan proteinlere çevrilebilir) veya negatif sarmal virüslerdir. Bu nükleik asit sınıflandırmalarından birine düşen tüm virüsler, nükleokapsidin (protein kaplaması ve kapalı nükleik asit) çubuk benzeri veya poligonal (genellikle ikosahedral) bir şekle sahip olup olmadığına bağlı olarak alt bölümlere ayrılır. İkosahedral virüsler ayrıca kapsidleri oluşturan kapsomerlerin sayısına göre ailelere bölünür. Son olarak, tüm virüsler nükleokapsidin bir lipoprotein zarfıyla çevrilip çevrilmediğine bağlı olarak iki sınıfa ayrılır. Bazı virologlar, virüsleri, bakterileri , bitkileri veya hayvanları enfekte edenler şeklinde sınıflandırır. Bu sınıflandırmalar, özellikle kuyruklu benzersiz bakteriyel virüsler için bir miktar geçerliliğe sahiptir, ancak konakçılara dayalı taksonominin işe yaramayacağı gibi çok fazla çakışma vardır. Virüslerin neden olduğu hastalıklara dayalı sınıflandırma da makul değildir, çünkü yakından ilişkili virüsler sıklıkla aynı hastalığa neden olmaz. Sonunda, virüslerin sınıflandırılmasının, şimdi olduğu gibi, yapısal bileşenlerden ziyade nükleotit sekanslarına ve replikasyon tarzlarına dayanması muhtemeldir. Temel taksonomik gruba, viridae soneki ile gösterilen bir aile denir. Virologlar arasındaki başlıca taksonomik anlaşmazlık, bir aile içindeki virüslerin belirli bir cinse ayrılıp ayrılmayacağı ve ayrıca tür isimlerine bölünüp bölünmeyeceğidir. 21. yüzyılın ilk on yılında, virüsleri italik türlere ve türlere bölerek, binom adlandırma sisteminin kullanımına doğru bir kayma meydana geldi. Bu, Uluslararası Mikrobiyolojik Dernekler Birliği üyesi uluslararası Virüs Taksonomisi Komitesi (ICTV) adına büyük ölçüde önemli bir hamleydi. ICTV, virüsler için evrensel bir sınıflandırma şeması tasarlama ve sürdürme sürecini de denetlemektedir. Virüs sınıflandırma hiyerarşisinde ICTV, aileleri, alt aileleri, cinsleri ve türleri tanır. Bu gruplara virüslerin yerleştirilmesi, belirli virüs türleri konusunda uzmanlardan oluşan çalışma grupları tarafından sağlanan bilgilere dayanmaktadır. ICTV sisteminde, her virüs türünün genellikle bir grup izolatı veya farklı nükleik asit sekanslarına sahip virüsleri temsil ettiği kabul edilir. Böylece, tek bir virüs türü bazen birden fazla izolat içerebilir. Bir türün izolatları benzersiz genetik dizilere sahip olmalarına rağmen, hepsi aynı çoğaltıcı soydan iner ve bu nedenle belirli genetik özellikleri paylaşır. Ayrıca, bir türün izolatları ortak bir spesifik ekolojik niş içinde gelişebilme yeteneğini ortak olarak paylaşır. Bilim adamları yeni izolatları ve türleri tanımladıkça, virüslerin sınıflandırılmasının giderek daha karmaşık hale gelmesi beklenmektedir. Aşağıdaki şema, ICTV sistemine göre sınıflandırıldıklarında iyi karakterize edilmiş DNA ve RNA virüslerinin örneklerini sunmaktadır.VİRÜSLERİ DAHA İYİ TANIMAK
Sınıflandırma
Taksonomik Özellikleri ile Ayırt Etme
Ek açıklamalı sınıflandırma
DNA VİRÜSLERİ
RNA VİRÜSLERİ
Reklam (#YSR)